Hititlere ait birçok sayıda yer tespit edilmiştir.Bunların en önemlisi şüphesiz Şapinuva' dır.Yapılan araştırmalar Hititlerin Ortaköy topraklarında köklü bir medeniyet kurduklarını göstermektedir. Şapinuva' nın bir dönem Hititlere başkentlik yaptığı anlaşılmıştır.Hitit Devleti’nin yıkılışından sonra, Anadolu’da 300 yıllık bir karanlık devir yaşanmıştır.
M.Ö. 800 yıllarında Asur kaynaklarında “Muşki” olarak geçen Frigler, merkezi Gordion olmak üzere Kızılırmak yayı içindeki bölgede bir devlet kurarak tarih sahnesine çıkmışlardır.Friglerin tarih sahnesinden silinmesinden sonra Ortaköy' ün bulunduğu topraklar Medlerin hakimiyetine girmiştir.
Medlerin yıkılmasının ardından Ortaköy' ün bulunduğu topraklar Perslerin hakimiyetine geçmiş.Bugün Şapinuva kazı alanında bulunan B Binası içerisinde kapıdan girince sağ köşede bir mezar taşı göze çarpar.Yapılan incelemeler sonucunda mezarın bir Pers mezarı olduğu anlaşılmıştır.Perslerden sonra Anadolu, hızla Büyük İskender tarafından fethedilir.Kısa bir süreliğine Ortaköy bölgesi İskender İmparatorluğu yönetiminde kalmıştır.
Pontus Krallığı, İskender İmparatorluğu' nun yıkılmasından sonra Kuzey Anadolu' da kurulan krallıklardan biridir. Ortaköy' ün de dahil olduğu toprakları hakimiyetlerine almışlardır. İncesu Kanyonu' nda bulunan tarihi kalıntılar Pontus Krallığı döneminden günümüze kadar ulaşmayı başarmış eserlerdendir.
Yapılan araştırmalar sonucu M.Ö. 276 yıllarda bölgemizin Galatlar tarafından ele geçirildiği ve bölgede Hitit ve Friglerden sonra en çok iz bırakan medeniyet olduğu anlaşılmıştır.Galatlar, Büyük İskender İmparatorluğu' nun yıkılmasından sonra Anadolu' da kurulan krallıklardan biridir. Pontus Krallığı, Galatya Krallığı ve Kapadokya Krallığı hemen hemen aynı tarihlerde hüküm sürdüklerinden birbirleriyle savaşları olmuştur. Çorum, Amasya ve Ortaköy bölgeleri bu savaşlar sonucu zaman zaman el değiştirmişlerdir.Bölgemiz bir dönem Kapadokya Krallığı yönetimine de girmiştir.
